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该患者的血液样本进行了全外显子测序(Whole Exome Sequencing, WES),结果证实她患有CYP11B2/CYP11B1融合基因所致的11β-羟化酶缺乏症。近日,这项由迪安诊断和宁波大学附属第一医院内分泌科合作的研究成果,发表于国际期刊《Frontiers in Endocrinology》(五年影响因子5.9/内分泌学与代谢Q2)。
疾病背景 先天性肾上腺皮质增生症(congenital adrenal hyperplasia,CAH)是一组因肾上腺皮质激素合成途径中酶缺陷引起的疾病,为罕见的常染色体隐性遗传病。 其中,以21-羟化酶缺乏症(21-OHD)最为常见,占90%-95%。其次为11β-羟化酶缺乏症(11β-OHD),占5%-8%。11β-羟化酶由CYP11B1基因编码,催化11-脱氧皮质醇和11-脱氧皮质酮(DOC)转化为皮质醇和皮质酮。11β-羟化酶的缺乏导致11-脱氧皮质醇、DOC和睾酮水平升高,DOC和睾酮的蓄积导致高血压和男性化。而皮质醇生成不足会刺激促肾上腺皮质激素(ACTH)的释放,导致肾上腺皮质增生。
临床表现
该患者是一名37岁的女性(核型为46,XX),童年时存在生长加速,且婚后一直未怀孕。2019年因疑诊双侧肾上腺肿瘤入院(图1A),前后进行了两次肾上腺切除术。2022年,患者由于月经不规则被收入内分泌科,CT显示右肾上腺皮质增生复发(图1B),体格检查显示该患者皮肤色素沉着,面部有痤疮和胡须,呈现男性化体征,生化检查提示低钾性高血压,高雄血症。均提示11β-OHD诊断。
图1 患者腹部CT影像
检测结果
该患者血液样本送至迪安诊断实验室进行肾上腺皮质增生检测(包含全外显子测序和CYP21A2检测)。检测结果显示,CYP21A2基因未发现任何变异,但经全外显子测序发现患者检出一个位于CYP11B1基因1号外显子的错义突变CYP11B1:c.203T>G (p.Val68Gly)(图2A、2B)。该变异未曾在数据库和文献中被报道,通过对该变异的保守性和三维蛋白结构的分析(图2C、2D),考虑该变异可能为致病性。
图2 CYP11B1:p.Val68Gly检测结果及分析 同时,基于全外显子测序的拷贝数变异分析(WES-CNV),检出一个覆盖CYP11B2基因7-9号外显子和CYP11B1基因1-6号外显子的拷贝数缺失(图3A),随后通过验证证实了该拷贝数缺失的真实性(图3C)。 由于CYP11B1和CYP11B2基因存在高度同源性,该缺失形成了一个由CYP11B2基因1-6号外显子和CYP11B1基因7-9号外显子组成的CYP11B2/CYP11B1融合基因(图3B),该融合基因受到CYP11B2启动子的调控,导致CYP11B1的异位表达和11β-羟化酶活性下降。 图3 CYP11B1/CYP11B2融合基因
研究小结 CYP11B1/CYP11B2融合是导致11β-羟化酶缺乏症的重要原因,但由于CYP11B1和CYP11B2的高度同源性,该融合基因通常难以检测。本研究是目前首例对于使用全外显子测序检测出融合基因所致的11β-羟化酶缺乏症患者的报道,还同时发现了CYP11B1:p.Val68Gly新型突变,扩大了CYP11B1基因的变异图谱。 随着二代测序(Next-generation Sequencing, NGS)的发展,全外显子测序已成为大多数单基因遗传病的一线诊断方法。全外显子测序主要检测的变异类型为单核苷酸变异(SNV)和小片段的插入缺失(InDel),而基于全外显子测序的拷贝数变异分析,可以补充分析拷贝数变异(CNV),达到外显子级别,在罕见遗传病的临床诊断中发挥了关键作用。
迪安诊断CAH相关基因检测项目
迪安诊断临床基因组中心严格按照ISO15189认可和美国CAP认证要求进行实验室标准和规范的管理,具备样本检测、生信分析、报告解读、遗传咨询、自主研发等综合能力,积极参加并高水平通过NCCL、CAP、EMQN多项高通量测序室间质评。中心开发了基于全外显子测序、家系全外显子测序以及全基因组测序的遗传病分析流程,能够完成各类遗传性疾病的筛查与诊断。