近日,浙江大学医学院附属邵逸夫医院甲状腺头颈外科与迪安诊断临床基因组中心联合开展研究,通过靶向RNA测序技术,在1例33岁女性甲状腺髓样癌患者中,发现并验证了3种未报道的NTRK2基因融合变异。
该研究成果发表在国际期刊《Discover Oncology》(IF= 2.9)上。这一重大发现不仅进一步拓展了NTRK2融合伴侣基因谱,也为甲状腺髓样癌患者的精准诊断与靶向治疗提供了新思路和新选择。

论文发布截图
● 研究背景
甲状腺髓样癌(MTC)是起源于甲状腺滤泡旁C细胞的罕见神经内分泌肿瘤,其分子发病机制复杂。手术切除是MTC的主要治疗手段,但对于晚期或转移性患者,靶向治疗已成为改善患者预后的重要选择。
NTRK(NTRK1、NTRK2、NTRK3)基因融合作为强效致癌驱动因子,在多种肿瘤中可被原肌球蛋白受体激酶(TRK)抑制剂精准靶向。美国食品药品监督管理局(FDA)已先后批准拉罗替尼(larotrectinib)、恩曲替尼(entrectinib)、瑞普替尼(repotrectinib)这三种药物,用于治疗携带NTRK基因融合的实体瘤患者。NTRK2融合在甲状腺髓样癌中极为罕见,此前全球范围内公开报道中仅1例相关病例存在NTRK2融合。
● 临床特征
研究对象为1名33岁女性患者,因当地医院细针穿刺提示为甲状腺髓样癌,前往浙江大学医学院附属邵逸夫医院就诊。该患者自诉无发热畏寒、无心悸胸闷、无消瘦盗汗、无声音嘶哑及饮水呛咳等特殊不适,无甲状腺髓样癌家族史。
影像学检查(图1 A-D):2024年11月27日超声检查显示,甲状腺左叶中下/中/外可见一枚大小为1.86×0.85×1.33cm的低回声结节(C-TIRADS 6级);
手术治疗:2024年12月16日,该患者接受全甲状腺切除术,同时同步实施右侧功能性颈淋巴结清扫、根治性颈淋巴结清扫及左侧甲状旁腺自体移植术;
病理与免疫组化(图1 E-I):手术标本病理检查明确诊断为甲状腺髓样癌,伴低级别腺内播散,肿瘤大小为1.8×1.4×0.8cm,pT1bN0Mx。免疫组化结果显示Calcitonin(+)、CgA(+)、Syn(+)、TG(-)、TTF-1(+)、Ki-67(2%+)、PHH3(少量+)、CongoRed(+)、PTH(-)、CEA-R(+)、CD56(+);
术后随访:术前患者降钙素、CEA升高,术后降钙素快速下降并逐步降至检测下限;术后1、6个月复查指标持续理想,颈部超声未见复发,已达生化治愈。

图1. 超声和免疫组化结果
● 测序结果
患者手术标本采用迪安诊断甲状腺癌基因检测产品(迪佳安Plus)进行靶向RNA测序,结果显示该患者检出3种罕见新型NTRK2融合变异,分别为:GTF2I-NTRK2 (G9:N13)、 GTF2I-NTRK2 (G9:N14)、 NTRK2-GTF2I (N12:G11)(图2),数据分析结果采用IGV软件进行人工复核及可视化(图3)。

图2. NTRK2融合结构示意图

图3. IGV可视化NTRK2融合序列
● 结果验证
为了验证该患者检出的3个罕见NTRK2融合的真实性,研究团队进一步采用Sanger测序进行实验验证。Sanger测序结果(图4)和靶向RNA测序结果一致。

图4. NTRK2融合的Sanger测序验证结果
● 研究讨论与启发
1、诊断层面
RNA测序是检测基因融合的优选手段之一。研究证实,与DNA测序、免疫组化(IHC)、荧光原位杂交(FISH)等传统检测方法相比,RNA测序可直接识别嵌合转录本,检测特异性更高,能有效避免罕见融合变异的漏检。RNA测序在罕见融合检测中具有不可替代的优势,为临床精准诊断提供了可靠技术支撑。
2、治疗层面
为MTC患者提供靶向治疗选择。甲状腺髓样癌的经典驱动基因相对清晰:遗传性MTC中95%-98%由胚系RET突变驱动,散发性MTC中25%-40%存在体细胞RET突变,RAS家族突变约占28.9%,而NTRK2融合在MTC患者中的检出率极低。
本案例检出3种新型NTRK2融合,提示在RET/RAS双阴性的MTC患者中,NTRK2融合作为潜在驱动事件的可能性值得高度关注。临床研究报道,携带NTRK2基因融合的实体瘤患者可从TRK抑制剂治疗中获益,为患者提供了新的靶向治疗机会。
3、研究层面
探讨了同一患者体内多种基因融合共存的可能机制。本研究中,同一患者体内存在三种NTRK2基因融合,融合伴侣相同但融合断点和方向不同,这是肿瘤基因组高度复杂性和异质性的体现,可能源于MTC细胞固有的基因组不稳定性和DNA修复缺陷。
NTRK2与GTF2I基因所在的染色体区域可能存在易断裂位点,通过易错的DNA修复机制在重组过程中产生了不同断裂点的融合。不同断点可能影响融合蛋白活性,进而改变肿瘤侵袭性和靶向治疗响应。
● 总结
NTRK基因融合是多种成人和儿童实体瘤的致癌驱动基因及治疗靶点。本研究基于靶向RNA测序,首次报道NTRK2三种融合并存的病例,不仅扩展了NTRK2融合伴侣基因谱,也为患者术后复发提供了新的治疗选择。